虚拟筛选方法在新冠病毒药物研发中的应用 系列讲座通知

2020-03-03 00:00:00 来源:源资信息科技(上海)有限公司

新型冠状病毒蛋白晶体结构的解析,例如新冠病毒刺突蛋白电镜结构、ACE2的全长结构、新型冠状病毒表面刺突糖蛋白受体结合区RBD与人受体ACE2蛋白复合物的晶体结构等,为药物筛选以及疫苗的设计奠定了坚实的基础。

晶体结构的解析能帮助研究人员开展后续工作:

1. 进行药物筛选,发现与蛋白结合并破坏其功能的化合物;

2. 设计与蛋白结合并抑制其功能的新型蛋白分子或抗体;

3. 设计出蛋白的变体,如使其拥有更高表达水平或热稳定性,从而诱发更强的免疫反应,加快疫苗开发。


本次讲座将以新冠病毒刺突蛋白结构为靶标,进行药物筛选,帮助大家快速掌握基于受体虚拟筛选方法、基于配体虚拟筛选方法,和先导物改造方法。

 注:新冠病毒蛋白文献下载链接: https://pan.baidu.com/s/1qfxu3rsVP5ZxvXG9iQJZYw (提取码:835e)

 

讲座主题:虚拟筛选方法在新冠病毒药物研发中的应用

讲座形式:网络讲座

讲座费用:免费

 

基于受体:

OEDocking是分子对接工具包,包含多种对接工具。

其中,FRED是使用广泛的对接工具。如果受体的结晶结构中有原始配体的话,可以使用HYBIRD工具来进行虚拟筛选。与其他方法相比,HYBRID的筛选性能较高。另外,当有一系列的配体-受体复合物晶体结构时,HYBRID能自动确定适合化合物结合的晶体结构。


基于配体:

ROCS是一个功能强大的虚拟筛选工具,可以快速识别具有与已知先导化合物三维形状和化学特征类似的潜在活性化合物。

vROCS是创新的图形用户界面,能够直接与ROCS联用。vROCS还提供了强大的提问结构编辑器,能辅助设计复杂的提问结构。vROCS还包含一组统计工具来评估不同提问结构的筛选性能。

EON是一个静电相似性比较工具,用于比较预先叠合好的分子间的静电相似性,能够发现结构完全不一样,但是形状与静电很相似的化合物,并由此得到骨架全新的先导物。


先导物结构优化:

BROOD是一个基于片断的全新药物设计工具,可以完成片断替换的分子设计工作。BROOD通过对选定的骨架或侧链片断用形状与静电相似的其它片断进行替换以生成全新的化合物,替换同时还会考虑新生成化合物的分子性质。BROOD方法有较多用途:先导物跃迁、侧链枚举、专利突破、片断连接、性质优化、扩大专利保护空间等。


虚拟筛选方法在新冠病毒药物研发中的应用:


报名及参与步骤:

① 扫描以下二维码报名;

② 报名成功后,您将在培训前一天收到会议链接邮件;

③ 培训开始前15分钟进入链接即可。

注:报名截止日期:第一讲2020年3月2日8:00;第二讲2020年3月9日8:00;第三讲2020年3月16日8:00。


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