2018-11-19 00:00:00 来源:源资信息科技(上海)有限公司
讲座主题:OpenEye在先导化合物发现中的应用
讲座形式:网络讲座
讲座费用:免费
讲座时间:11月19日9:30-10:30
报名截止日期:2018年11月16日
发现一个结构新颖且活性较好的化合物通常是药物研发过程中的一个重难点,通过实验筛选获得新结构的传统方法成本高、耗时长。
虚拟药物筛选是将药物筛选的过程在计算机上进行模拟,基于某个度量标准对化合物库中的分子进行打分,分子打分顺序由高到低排列,选择打分较高的分子用来进行下一步实验测试,这样就能够集中目标,大大降低实验筛选化合物的数量,从而缩短研发周期、节约经费开支。
本期讲座主要给大家介绍两类虚拟筛选工具:基于靶标的虚拟筛选工具和基于配体的虚拟筛选工具。
基于配体:
ROCS是一种功能强大的虚拟筛选工具,可以快速识别具有与已知先导化合物形状类似的潜在活性化合物。
vROCS是创新的图形用户界面,能够直接与ROCS联用。vROCS还提供了强大的提问结构编辑器,使用户能够设计复杂的提问结构。vROCS还包含一组统计工具来评估不同提问结构的性能。
EON是一款静电比较工具,用于比较预先叠合好的分子间的静电相似性,能够发现结构完全不一样,但是形状与静电很相似的化合物,并由此得到骨架全新的先导物。
基于靶标:
OEDocking是分子对接工具包,包含多种对接工具。
其中,FRED是用来虚拟筛选的使用的最为广泛的对接程序。如果靶标蛋白的结晶结构中有原始配体的话,我们可以使用HYBIRD来进行虚拟筛选,与其他方法相比,HYBRID的筛选性能显著提高。另外,当有一系列的配体-受体复合物结晶结构时,HYBRID可以自动确定最适合指导新的配体对接的复合物。
OpenEye在先导化合物发现中的应用系列讲座内容:
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